Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF22A3QJZ6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms