Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC78A2IDD5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC78A2IDD5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms