Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPDC1A2A3K4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms