Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRGMA1A4Y4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms