Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6U4

TRAV7, T-cell receptor alpha variable 7 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV7A0A075B6U4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAV7A0A075B6U4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TRAV7A0A075B6U4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TRAV7A0A075B6U4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TRAV7A0A075B6U4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TRAV7A0A075B6U4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TRAV7A0A075B6U4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRAV7A0A075B6U4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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