Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms