RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466893.5

PTPRG-AS1-202, PTPRG antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PTPRG-AS1, Length 823 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 FOXD1Q16676 465 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 POTEDQ86YR6 584 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 MSH5O43196 834 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 ADRA2BP18089 450 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 RNF39Q9H2S5 420 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 KCNA4P22459 653 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 POTEHQ6S545 545 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 DSG3P32926 999 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CAPN15O75808 1086 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 ABCB7O75027 752 aa15.08■□□□□ 0
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 APLP2Q06481 763 aa15.08■□□□□ 0
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SLC4A2P04920 1241 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 ZBTB22O15209 634 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 POLA2Q14181 598 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 AKT1S1Q96B36 256 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 HAX1O00165 279 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.17□□□□□ -0.14
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PITPNM1O00562 1244 aa14.12□□□□□ -0.15
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 EVX2Q03828 476 aa14.06□□□□□ -0.16
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 OSCARQ8IYS5 282 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 LHX8Q68G74 356 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 GABBR2O75899 941 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SPDYE2BA6NHP3 402 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SPDYE6P0CI01 402 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 FBLN2P98095 1184 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.65□□□□□ -0.22
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 FKBP8Q14318 412 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CHADLQ6NUI6 762 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 POTEIP0CG38 1075 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CLCN6P51797 869 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PRR29P0C7W0 189 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PROM2Q8N271 834 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 POTEMA6NI47 508 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 OTUD5Q96G74 571 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 POTEGQ6S5H5 508 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13□□□□□ -0.33
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 POTEB2H3BUK9 544 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 FBXO3Q9UK99 471 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 VASPP50552 380 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 CREBZFQ9NS37 354 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRG-AS1-202ENST00000466893 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms