Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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HOXD10P28358 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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