Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
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PTPRGP23470 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
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PTPRGP23470 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
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PTPRGP23470 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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PTPRGP23470 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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PTPRGP23470 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
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PTPRGP23470 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC8.84□□□□□ -1
PTPRGP23470 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRGP23470 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRGP23470 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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