Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB1AP62820 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms