Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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