Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms