Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 GZMA-201ENST00000274306 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms