Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTK-202ENST00000372880 2248 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TATDN2P2-201ENST00000403590 2226 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RCAN2-202ENST00000330430 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTNL2-203ENST00000454136 1460 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MS4A14-209ENST00000531787 2537 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PMEL-218ENST00000552882 2516 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT3-202ENST00000396425 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL18R1-201ENST00000233957 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDPN-201ENST00000294489 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008132.1-201ENST00000419447 2068 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092135.1-201ENST00000623398 2059 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALAS1-205ENST00000484952 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024614.4-201ENST00000637454 2396 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GMEB2-202ENST00000370069 4011 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRAMD1B-201ENST00000322282 2571 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAT2-201ENST00000314128 3259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMA1-289ENST00000640807 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 VIPR1-AS1-201ENST00000452639 1435 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMTNL1-201ENST00000399154 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC46-201ENST00000269025 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLEC4F-202ENST00000426626 2012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM47B-201ENST00000329357 2120 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTRH2-202ENST00000409433 2246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF19-205ENST00000564230 2205 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 QARS-202ENST00000414533 2412 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBASH3A-202ENST00000319294 2504 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP8B5P-204ENST00000439972 2522 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD4-201ENST00000011653 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AK7-201ENST00000267584 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms