Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms