Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC021506.1-201ENST00000581971 597 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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