Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FRMPD4Q14CM0 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FRMPD4Q14CM0 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms