Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ADA2-204ENST00000399839 3986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AL355103.1-201ENST00000557246 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPREP23469 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 RNF145-211ENST00000521606 2658 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC091940.1-204ENST00000507318 3091 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 MAGEB16-205ENST00000399992 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTPREP23469 EIF4BP5-201ENST00000567338 1795 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ALKBH8-202ENST00000389568 2491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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