Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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