Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 KCND2-201ENST00000331113 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM52B-201ENST00000298530 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 VIT-202ENST00000379242 2810 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 STYK1-201ENST00000075503 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 GRAMD1B-206ENST00000529432 6266 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ANAPC16-201ENST00000299381 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 FOXN4-201ENST00000299162 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MYO15A-203ENST00000418233 3411 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SPRTN-204ENST00000391858 3559 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SEPT2-201ENST00000360051 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ARHGEF4-201ENST00000326016 3666 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 BMF-202ENST00000397573 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TNC-211ENST00000537320 4946 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TTC30A-201ENST00000355689 5975 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PMEPA1-201ENST00000265626 4627 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 HMGCLL1-201ENST00000274901 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 LRTOMT-201ENST00000289488 2332 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ANPEP-201ENST00000300060 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CAPN9-202ENST00000354537 2484 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ANKRD18CP-201ENST00000354752 2980 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 FHAD1-202ENST00000358897 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 EBF3-202ENST00000368648 4375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CYP4A11-202ENST00000371904 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 NLRP3-205ENST00000391827 2940 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MROH8-203ENST00000400441 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 OSTCP6-201ENST00000407493 457 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PDCL3P6-201ENST00000429744 706 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AL138957.1-201ENST00000435156 342 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC246785.1-201ENST00000440916 264 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01281-202ENST00000448597 1773 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 Z82173.1-201ENST00000453924 484 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP2-2Q9BYT5 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms