Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A4Q9Y6R1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms