Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms