Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C3Q9Y5Q9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms