Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V2

CARHSP1, Calcium-regulated heat-stable protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARHSP1Q9Y2V2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CARHSP1Q9Y2V2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms