Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3M1Q9Y2T2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms