Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms