Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
CHIC2Q9UKJ5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms