Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms