Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MLH3Q9UHC1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms