Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APEX2Q9UBZ4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms