Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPASTQ9UBP0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms