Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD4AQ9P2Q2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms