Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms