Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EHD3Q9NZN3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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