Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBP1Q9NZI7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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