Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms