Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CWC25Q9NXE8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CWC25Q9NXE8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms