Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COMMD8Q9NX08 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COMMD8Q9NX08 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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