Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms