Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT57Q9NWB7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms