Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBM28Q9NW13 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms