Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO28Q9NVF7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms