Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDP1Q9NUW8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TDP1Q9NUW8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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