Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPANXA1Q9NS26 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPANXA1Q9NS26 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms