Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASS4Q9NQ75 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASS4Q9NQ75 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASS4Q9NQ75 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms