Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms