Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF1Q9H7N4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms