Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL3Q9H2J4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms