Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms