Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRCC1Q9C099 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms